Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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