Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRDM2Q13029 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
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