Protein–RNA interactions for Protein: Q12968

NFATC3, Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFATC3Q12968 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFATC3Q12968 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFATC3Q12968 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms