Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STX4Q12846 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STX4Q12846 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STX4Q12846 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STX4Q12846 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
STX4Q12846 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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STX4Q12846 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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STX4Q12846 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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STX4Q12846 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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STX4Q12846 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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STX4Q12846 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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STX4Q12846 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
STX4Q12846 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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STX4Q12846 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
STX4Q12846 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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