Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFCP2Q12800 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFCP2Q12800 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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