Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWF1Q12792 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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