Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms