Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP4F3Q08477 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms