Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TGM3Q08188 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms