Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms