Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FMODQ06828 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms