Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF8Q02556 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms