Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN7AQ01118 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms