Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC42EP1Q00587 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms