Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTG1P63261 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms