Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P61574 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms