Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXW4P57775 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms