Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms