Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPOLAP51003 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLAP51003 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms