Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM4P49221 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM4P49221 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM4P49221 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM4P49221 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM4P49221 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM4P49221 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM4P49221 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM4P49221 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM4P49221 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM4P49221 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM4P49221 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM4P49221 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms