Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1DP48730 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms