Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDH1P40925 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDH1P40925 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms