Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DDIT3P35638 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms