Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC13P31276 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms