Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP1P29466 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP1P29466 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP1P29466 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP1P29466 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms