Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GADD45AP24522 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms