Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A1P23297 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms