Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA6P23229 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms