Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USF1P22415 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF1P22415 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF1P22415 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
USF1P22415 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF1P22415 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF1P22415 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF1P22415 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USF1P22415 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF1P22415 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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