Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BGNP21810 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BGNP21810 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BGNP21810 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BGNP21810 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BGNP21810 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BGNP21810 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BGNP21810 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BGNP21810 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BGNP21810 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BGNP21810 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BGNP21810 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BGNP21810 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BGNP21810 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms