Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NF1P21359 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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NF1P21359 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NF1P21359 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NF1P21359 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NF1P21359 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NF1P21359 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NF1P21359 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NF1P21359 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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NF1P21359 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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NF1P21359 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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NF1P21359 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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NF1P21359 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NF1P21359 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NF1P21359 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NF1P21359 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NF1P21359 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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