Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCP20941 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCP20941 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCP20941 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCP20941 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCP20941 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms