Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms