Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRHP20396 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRHP20396 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRHP20396 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRHP20396 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRHP20396 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms