Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCLP18206 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCLP18206 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCLP18206 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCLP18206 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCLP18206 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms