Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A1P13866 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms