Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DOBP13765 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms