Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLBP1P12271 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms