Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VSIG8P0DPA2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms