Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CALM1P0DP23 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms