Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf89P0DMQ9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms