Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NGFRP08138 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NGFRP08138 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NGFRP08138 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NGFRP08138 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
NGFRP08138 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NGFRP08138 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NGFRP08138 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms