Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDHBP07195 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LDHBP07195 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDHBP07195 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LDHBP07195 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LDHBP07195 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHBP07195 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHBP07195 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHBP07195 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHBP07195 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHBP07195 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms