Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSD2O96028 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSD2O96028 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSD2O96028 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSD2O96028 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD2O96028 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD2O96028 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD2O96028 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD2O96028 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD2O96028 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NSD2O96028 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD2O96028 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD2O96028 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD2O96028 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD2O96028 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD2O96028 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSD2O96028 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms