Protein–RNA interactions for Protein: O94823

ATP10B, Probable phospholipid-transporting ATPase VB, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10BO94823 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP10BO94823 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP10BO94823 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms