Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms