Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL41O60662 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms