Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAB2O43741 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAB2O43741 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms