Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYT7O43581 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYT7O43581 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT7O43581 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT7O43581 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms