Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM2O43147 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms